中国秦朝，秦始皇为统一中国而征服岭南，命大秦军队开赴桂林郡兴安修建灵渠，用以运送兵粮。时逢大旱之年，骆越部落首领诺莫吉的孙女依达妮为了祈求上天降雨，愿意牺牲自己祭献天神。她在祭祀仪式中的美妙歌声（咏叹调《迷茫的心》），吸引了带领军队路过此地，准备前往修建灵渠工程的大秦将军于轩和。于轩和被依达妮的美丽善良所打动， 制止了部落巫师都拉乌主持的祭祀活动。依达妮心存感激，但也担忧旱情如何解决。于轩和向依达妮和骆越民众说明大秦军队奉秦始皇之命前来修建灵渠运河的目的，在联通长江水系和珠江水系方便运输兵粮的同时，还可以解决当地的水源问题，于轩和的话和气度打动了依达妮。好客的骆越民众载歌载舞的欢迎大秦军队，部落武士头领亚洛一直爱恋依达妮，于轩和也为依达妮而动心。诺莫吉老爹、亚洛与都拉乌对是否欢迎大秦军队修建灵渠产生争执（男声三重唱）。于轩和请诺莫吉老爹、依达妮、亚洛、都拉乌等人去大秦军营赴宴，共同商量修建灵渠运河事宜。于轩和带领大秦军队继续进军，依达妮与骆越民众相送。
大秦军营，于轩和独自研究灵渠资料，若有所思回想对依达妮的爱恋感觉，此时，侍女玉儿禀报骆越客人到军营。酒席间于轩和向众人说明大秦修建灵渠的计划和修建灵渠对骆越部落的重要性，并请教老爹当地的地理地貌和风土人情（宣叙调），老爹（宣叙调）告诉了于轩和相关情况并表达对修建灵渠的支持。玉儿演奏古琴为酒宴助兴，依达妮被音乐所感染，随着音乐翩翩起舞。歌舞中间，于轩和起身和着依达妮舞剑助兴，两人相互抒发情怀。亚洛在一旁看见醋意大发， 持刀与于轩和对峙，并执意要与于轩和比武决斗。
第二天，部落圣地的泉水旁，亚洛全副武装与部落武士们杀气腾腾地等待于轩和的到来。而于轩和不带一兵一卒， 布衣佩剑，在玉儿的陪同下赴约（二重唱）。于轩和表达了对依达妮的爱恋，并表示情感是个人私事，不要影响军队与部落共同修建灵渠。前来调解的诺莫吉老爹和依达妮劝说双方应以大局为重，不要决斗，然而亚洛坚决不从。正在争执之间，忽报外族部落大举入侵圣地欲争夺水源。诺莫吉老爹上前与对方头领对话，谈判之中，都拉乌指使手下用冷箭射死对方的武士，以激化矛盾。对方头领大怒，举刀砍伤老爹，双方陷入一片混战之中。于轩和协助部落抢回伤重的老爹，并为救依达妮而受伤，他的英勇和真诚感动了亚洛。诺莫吉老爹临终前嘱咐依达妮继续帮助大秦军队修建灵渠，同时要提防都拉乌的阴谋。
诺莫吉老爹的葬礼上，几十面铜鼓敲击、众人舞蹈、八位壮汉挥长刀砍牛祭祀老爹。依达妮手捧象征骆越部落权利的牛角歌唱（咏叹调《我心向往》），表达对生命、幸福生活和爱情的向往与追求，表示一定要解决水源问题，制止流血斗
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争，并要披麻戴孝为大秦军队修建灵渠做向导。亚洛也表示要协助依达妮完成老爹的遗愿。于轩和表达对依达妮的爱意。都拉乌暗暗在心中盘算，除掉了老爹，只要再除掉依达妮就可以夺取首领位置。
半年后，灵渠修建工地。骆越民族男女青年对情歌，于轩和、依达妮也互相表达爱恋之情和憧憬未来的幸福生活，相约灵渠修通之时，就是他们的大婚之日。按照勘测设计的施工方案，灵渠必须穿越骆越部落的圣地，工地施工即将在部落圣地进行。都拉乌煽动部落的族民，说依达妮被大秦汉人所诱惑，背叛了骆越民族，要来破坏圣地，并鼓动族民去灵渠工地闹事，阻挠工程的进行（都拉乌领唱，众人愤怒、指责的合唱）。于轩和、依达妮等人劝导骆越部落的武士和民众，于轩和、依达妮（二重唱）讲明修建灵渠带给部落的好处以及老爹的遗愿。众人质疑，不知道应该相信谁。此时秦始皇钦差大臣监察御史史禄驾到颁诏圣旨，秦始皇圣命史禄统领灵渠工程的修建，尽快修通灵渠运河，如有人阻拦格杀勿论。大秦军队与骆越民众武力对峙，气氛大有一触即发之势。依达妮劝导骆越民众不要无谓牺牲，冲击灵渠工地是违抗圣旨， 会惹来整个部落的杀身之祸。亚洛告诉骆越民众，灵渠是要穿过部落圣地，但先要经过诺莫吉老爹的墓地和依达妮的家园，依达妮为了部落永久解决水源问题，宁愿牺牲自己个人的利益，也要确保灵渠工程的顺利进行。史禄感谢依达妮对灵渠工程的无私支持，希望骆越民众以国家和民族的利益为重，以修建灵渠的大局为重，同时强调皇命圣旨是任何人都不能违抗的。于轩和奉史禄之命带领军队加强工地防卫，军队与骆越民众的对峙气氛更加紧张。都拉乌命手下对于轩和射冷箭，企图激怒双方相互厮杀。依达妮在情急之下挺身为于轩和挡住了利箭，依达妮胸口中箭，于轩和冲上前去紧紧抱住依达妮。依达妮临终前唱咏叹调《天堂人间相连》表达自己对部落的热爱、对大秦汉人的感谢、对于轩和的爱情、对美好生活和生命的向往和眷恋。
民众和武士乱刀砍死都拉乌，拥向依达妮。在史禄、于轩和、亚洛的带领下，全体骆越民众和军士将依达妮放在一个用华盖罩着的抬架上高高抬起，高唱颂歌，在辉煌灿烂的音乐中结束全剧。
