4． “习性的改变能产生遗传的效果”，这个结论是毋庸置疑的。如果一个器官长期不被使用，那么它就会退化甚至消失，这样的例子比比皆是。我们把荷兰郁金香移植到中国来培育，就会发现它的开花期发生了变化。越野生的动物，耳朵越大越灵敏；而越高级的动物，耳朵越小，因为它们已经很少因为受到惊吓而竖起耳朵，耳肌退化，这也可以解释为何今天人类根本就没有竖起耳朵的功能了。我们若看到那些极少数可以由大脑支配耳肌发生运动的人，我们可以直接给他/她打上烙印：你返祖了。
15． 有人说“选择原理”在培育物种时成为有计划的实践是近几十年产生的思潮，这显然是错误的。人类从古代开始，就有选择地挑选并且培育着物种。英国在中世纪进口动物时，马的体格在一定尺度之下的就会被消灭，可见这是在挑选高大的优良品种。中国北魏贾思勰的《齐民要术》中提到拔出植物中的“无赖汉”，这也是在淘汰劣质品种。可能在古代，人类在进行这些挑选时并没有明确认识到“选择原理”，但是这些行为足以证明当时人类已经注意到家养生物的繁育，并且切切实实地进行了优胜劣汰。而“选择原理”被提出只有200多年又何妨？不过是一种远古存在的真理近期被命了名罢了。
30． 所谓的初期物种指的其实就是新的物种，新物种的产生可不是那么容易的。任何变种如果想成为一种永久的新物种，必定要和其生活环境中的其它居住者进行生存斗争。只有在生存斗争中胜利，新的变种才能够存活下来并且繁衍后代。这些后代的变异程度虽然极可能非常轻微，但是他们毕竟遗传了双亲优于同地区其它生物的性状。这里的生存斗争，是特指相似生物之间的生存斗争，尤其是那些同属同纲的，而不是指植物与动物之间、动物与微生物之间的弱肉强食。我们都知道我们生存的地球资源有限，从古至今一向如此。如果同类的生物不为自己的生存进行资源争夺并且具有一定的战斗力，那么它的结局必然是灭亡。
38． “生存斗争”是一个非常广义的词语，它指一种生物对另一种生物的依存关系，更重要的是其中包含着个体的生存以及是否可以成功地繁殖后代。两只狗在饥饿的时候要因食物而斗争；生长在沙漠的植物要与干旱的气候做斗争；一种植物无法在一个地区繁殖过多，它们在与相同环境里的其它相似植物斗争；沙漠边缘的植物每一千粒种子中只有一粒可以存活，它们相互之间在斗争；槲寄生的种子需要鸟类来散布繁殖，这是它们在和果实类植物进行斗争……这些截然不同的斗争方式，都是自然界中非常普遍的，为了方便，我们将其统称为生存斗争。
52． 人工选择其实不是指直接由人力造成的家养生物的变异，就像直接给动物打一针，或者把植物关进小黑屋无法导致变异。人类不能创造变种，也不能防止它们的发生，只能保存和累积它们。有时一些物种的变异是由人类无意做出的偶然选择导致的，在大自然中相似的环境变化也可以导致生物发生相应的变异。
既然人类利用各种手段实现了生物朝着对我们有利的变异发展，那么生物本身难道就不会朝着对自己有利的大自然选择方向发展吗？难道它们非要跟自然对着干，然后导致自身死亡、种群灭绝么？有用的变异被保存下来并遗传下去，有害的变异被灭绝，这就是“适者生存”。
108． 物种就是一些我们可以鉴别的、界限明显的生物。在任何时期，都不会因为一个物种拥有诸多特征明显的过渡类型而变得不可分解、一片混乱。因为第一，新的变种的形成需要漫长的时间，而在某一时刻我们看到的中间类型往往是极少数。第二，有些连续的地域在很久远的年代前是断裂的，在成为连续性区域的过程中，一些中间类型曾经存在过，但是现在已在自然选择过程中灭绝了。第三，在两个或者两个以上变种存在的中间地带，必然存在一些过渡类型，但由于存在时间同样短暂，它们必然被所连接的那些类型压倒和代替。最后，从生物存在的漫长时期来看，化石证明了某些中间类型的存在，虽然这些化石是间断而不完全的。
117． 有句名言说：“自然界在变化方面是奢侈的，在革新方面却是吝啬的。”自然界存在那么多的变异，但是新的物种却很少。这是因为自然选择只是利用一些细微的、连续的变异对生物发生作用；它从来不采取“跃进”的方式使生物发生突变，或者说突变只发生在极个别的生物个体，而从来不会短暂地、突然地产生一个新的物种。从来没有哪个器官是没有经过过渡阶段而形成的，更不用说全新物种了。自然史里最有名的格言就是：“自然界里没有飞跃。”虽然在很多情况下，要猜测现在的器官是经过了哪些过渡形式发展到今天这种状态也是很难的事。相比已经灭亡了的物种，我们这个地球现存物种的数量是多么地微不足道。
282． “残迹器官”是指没有用处、或者几乎没有用处的生物器官。有用的器官，即便现在它已经很弱，但也不能被视为残迹器官，除非有证据证明它们以前曾高度发达。无用的残迹器官在之前演进阶段的发育中，能派上的用场比现在更少，所以它们不可能是通过自然选择或者变异而产生出来的，自然选择只保存有用的变异，它们往往是通过遗传的力量被保存下来的。有些功能同样很弱的器官是初生器官，要区别残迹器官和初生器官并不是一件容易的事，只有能够进一步进化发展的器官才能被称为初生器官。这种状态的器官是很罕见的，因为它总会被更完美的同一器官的后继者取代。
